Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP8Q9BV40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms