Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms