Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms