Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms