Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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