Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms