Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF559Q9BR84 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms