Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYD88Q99836 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms