Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF12Q99081 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF12Q99081 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms