Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms