Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN4Q96Q06 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms