Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP53Q96M91 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms