Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms