Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms