Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LIN37Q96GY3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms