Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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