Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms