Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCE1Q969G3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms