Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCG3Q8WXD2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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