Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSH3Q8TE77 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms