Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NBPF4-201ENST00000415641 2485 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AL121895.1-202ENST00000441208 2701 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PAX6-257ENST00000639409 2450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SVIPQ8NHG7 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms