Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms