Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP54Q7Z3B4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms