Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms