Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms