Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms