Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms