Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms