Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TREML4Q6UXN2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TREML4Q6UXN2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TREML4Q6UXN2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TREML4Q6UXN2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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