Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms