Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms