Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNS3Q68CZ2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms