Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARMC3Q5W041 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms