Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q5VSD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms