Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXDC1Q5TGL8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms