Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms