Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CC2D1BQ5T0F9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms