Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC158Q5M9N0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms