Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms