Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF628Q5EBL2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms