Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms