Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms