Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC58Q4VC31 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms