Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDNFQ49AH0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms