Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms