Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms