Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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