Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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LTC4SQ16873 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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