Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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