Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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